Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clec18aQ7TSQ1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Clec18aQ7TSQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms