Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN7

Igsf5, Immunoglobulin superfamily member 5, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf5Q7TSN7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Igsf5Q7TSN7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms