Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ClmQ7TSN2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ClmQ7TSN2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms