Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dsg1bQ7TSF1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dsg1bQ7TSF1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms