Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf18Q7TS55 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Tnfsf18Q7TS55 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tnfsf18Q7TS55 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tnfsf18Q7TS55 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Tnfsf18Q7TS55 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Tnfsf18Q7TS55 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Tnfsf18Q7TS55 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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