Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trim17Q7TPM3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trim17Q7TPM3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms