Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vma21Q78T54 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Vma21Q78T54 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vma21Q78T54 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vma21Q78T54 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vma21Q78T54 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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