Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sys1Q78S06 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sys1Q78S06 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms