Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nme8Q715T0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nme8Q715T0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nme8Q715T0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms