Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rpl35Q6ZWV7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rpl35Q6ZWV7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rpl35Q6ZWV7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpl35Q6ZWV7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpl35Q6ZWV7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rpl35Q6ZWV7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rpl35Q6ZWV7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rpl35Q6ZWV7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms