Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cnih3Q6ZWS4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cnih3Q6ZWS4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms