Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Igsf3Q6ZQA6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Igsf3Q6ZQA6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms