Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinlQ6ZQ12 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinlQ6ZQ12 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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