Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc44a1Q6X893 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc44a1Q6X893 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms