Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9c1Q6UJY2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc9c1Q6UJY2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms