Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Timd4Q6U7R4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timd4Q6U7R4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms