Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gja6Q6S5G4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gja6Q6S5G4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms