Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sort1Q6PHU5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sort1Q6PHU5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms