Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc82Q6PG04 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc82Q6PG04 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms