Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Taf1cQ6PDZ2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Taf1cQ6PDZ2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms