Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc85bQ6PDY0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc85bQ6PDY0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms