Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Chd4Q6PDQ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Chd4Q6PDQ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Chd4Q6PDQ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms