Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trak1Q6PD31 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trak1Q6PD31 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms