Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Usp49Q6P9L4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Usp49Q6P9L4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Usp49Q6P9L4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Usp49Q6P9L4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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