Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Senp6Q6P7W0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Senp6Q6P7W0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms