Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Atg2aQ6P4T0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg2aQ6P4T0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg2aQ6P4T0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms