Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ppp4r3aQ6P2K6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ppp4r3aQ6P2K6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms