Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Slx4Q6P1D7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Slx4Q6P1D7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Slx4Q6P1D7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms