Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pprc1Q6NZN1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pprc1Q6NZN1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Pprc1Q6NZN1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms