Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Soga3Q6NZL0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Soga3Q6NZL0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Soga3Q6NZL0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms