Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpdc1Q6NZK8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms