Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Szrd1Q6NXN1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Szrd1Q6NXN1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms