Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rprd2Q6NXI6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rprd2Q6NXI6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms