Protein–RNA interactions for Protein: Q6K1E7

Ggnbp1, Gametogenetin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp1Q6K1E7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ggnbp1Q6K1E7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ggnbp1Q6K1E7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms