Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn11Q6J756 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Capn11Q6J756 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms