Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Arhgap20Q6IFT4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms