Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Best3Q6H1V1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Best3Q6H1V1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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