Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gbf1Q6DFZ1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gbf1Q6DFZ1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms