Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rftn1Q6A0D4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rftn1Q6A0D4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms