Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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