Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Jmjd1cQ69ZK6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Jmjd1cQ69ZK6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Jmjd1cQ69ZK6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Jmjd1cQ69ZK6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Jmjd1cQ69ZK6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Jmjd1cQ69ZK6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Jmjd1cQ69ZK6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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