Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sptbn2Q68FG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sptbn2Q68FG2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms