Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gja3Q64448 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gja3Q64448 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gja3Q64448 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms