Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf4Q64287 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf4Q64287 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms