Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf1Q64213 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sf1Q64213 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms