Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
Ccdc18Q640L5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc18Q640L5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms