Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Col4a5Q63ZW6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col4a5Q63ZW6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms