Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pou4f3Q63955 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pou4f3Q63955 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms