Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Znf260Q62513 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Znf260Q62513 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms