Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vat1Q62465 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vat1Q62465 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms